税務調査

法人税務調査の事例と対策|実際のケースから学ぶ対応方法

iwamoto
税理士 岩本隆一
税理士 岩本隆一
登録番号140245
東京地方税理士会
横浜中央支部
Profile
岩本隆一税理士事務所代表
税理士業界歴19年。税務調査回数106回。無申告案件346件の経験を持つ税理士です。(2025/04/30現在)
【相談事例】
建設業A社は5年間無申告状態で税務調査が入りました。
①初回面談で詳細なヒアリング
②2回目の面談で税務調査対応の練習
③税務調査当日の適切な対応
④調査後に経費計上の交渉を行う
結果として当初想定指定した追徴税額5,000万円から1,200万円へと3,800万円の減額に成功したことがある。
【セミナー実績】
あなたの帳簿、AIに丸見えです!デジタル時代の税務調査リスクと防衛術(株式会社ジャイアントキリング主催)
電子帳簿保存法説明会(公益社団法人横浜中法人会研修委員会主催)
「岩本先生にお願いして本当によかった」と言われることが何よりの喜びです。
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税理士の岩本隆一です。税務調査のご依頼募集中です。

税務調査って、実は「運ゲー」じゃない話

どうも、みなさん。

法人の税務調査って聞くと、なんか「運が悪かったら来る」みたいなイメージありませんか?でも実際は全然そんなことなくて、ちゃんとした理由があって調査対象に選ばれるんですよね。

今日は実際の事例を交えながら、法人の税務調査でよくあるパターンと、その対策について話していきます。僕が20年近く税理士やってきて見てきた「リアル」をお伝えできればと思います。

そもそも、なぜその法人が選ばれるのか

税務署って、実はめちゃくちゃデータ分析してるんですよ。適当に選んでるわけじゃないんです。

選ばれやすい法人の特徴

  • 売上が急激に伸びている
  • 同業他社と比べて利益率が極端に低い
  • 過去に申告漏れがあった
  • 業界の平均と比べて経費率が異常に高い

要するに、「何かおかしくない?」って思われるような数字になってると、調査対象になりやすいということです。

実際にあった事例1:飲食店の「まかない」問題

これ、めちゃくちゃよくある話なんですが、ある居酒屋チェーンの事例です。

従業員のまかないを全部「福利厚生費」で処理してたんですね。でも税務署からすると「それって給与じゃない?」という話になったんです。

何が問題だったか

  • まかないの金額が1人月3万円相当
  • 従業員が自由に選べる仕組みになっていた
  • 現金で支給することもあった

結果的に、まかない代の一部を給与として認定され、源泉所得税の追徴課税を受けました。

対策のポイント まかないは「全員一律」「現物支給のみ」「常識的な金額」に抑えることが大切です。月1万円程度なら問題になることはほとんどありません。

実際にあった事例2:IT企業の「研究開発費」トラブル

これは最近増えてる事例なんですが、AI関連のスタートアップ企業での話です。

新しいサービス開発のための費用を全部「研究開発費」として処理していたんですが、税務署からは「それって通常の営業活動じゃない?」と指摘されました。

何が問題だったか

  • 既存事業の改良も「研究開発」として処理
  • 人件費の80%を研究開発費に計上
  • 明確な区分けができていなかった

対策のポイント 研究開発費として認められるのは「新技術・新製品の開発」に限られます。既存サービスの改良や保守は通常の経費として処理するのが安全です。

税務調査官が必ずチェックする3つのポイント

長年この業界にいて分かったんですが、調査官って必ず見るポイントがあるんですよね。

1. 役員報酬の妥当性

「社長の給料、高すぎない?」って話です。特に小さな会社で社長が月200万とか取ってると、「本当にその価値の仕事してます?」って突っ込まれます。

2. 交際費の内容

領収書に「○○様他」って書いてあると、「他って誰ですか?」って必ず聞かれます。家族との食事を交際費にしてるパターンも多いんですよね。

3. 外注費と給与の区分

「この人、実質的に従業員じゃないですか?」って指摘されるケースが激増してます。業務委託契約でも、実態が雇用関係なら給与として課税されちゃいます。

調査が来たときの「絶対やっちゃダメ」行動

これ、本当に大事なんですが、調査官が来たときに絶対やっちゃいけないことがあります。

NGな対応

  • 嘘をつく(バレたときのダメージが10倍になります)
  • 書類を隠す(隠蔽行為は重加算税の対象)
  • 感情的になる(調査期間が長引く原因に)

正しい対応

  • 事実をありのまま説明する
  • 分からないことは「分からない」と言う
  • 税理士に立ち会ってもらう

まとめ:税務調査は「準備8割」

結局のところ、税務調査って準備が全てなんですよね。

日頃から適切な帳簿付けをして、根拠となる資料をちゃんと保存しておけば、それほど怖いものではありません。

逆に言うと、普段から「これ、説明できるかな?」って意識で経理処理をしておくことが一番の対策になります。

今日からできる対策

  • 領収書にはメモを残す習慣をつける
  • 役員報酬は同業他社と比較検討する
  • 外注先とは明確な契約書を交わす
  • 定期的に税理士とコミュニケーションを取る

税務調査って、確かに面倒ですが、適切に対応すれば必要以上に怖がることはありません。むしろ、自社の経理体制を見直すいい機会だと捉えることもできます。

何か不安なことがあれば、早めに専門家に相談することをおすすめします。一人で抱え込まずに、一緒に解決していきましょう。




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    ①初回面談で詳細なヒアリング
    ②2回目の面談で税務調査対応の練習
    ③税務調査当日の適切な対応
    ④調査後に経費計上の交渉を行う
    結果として当初想定指定した追徴税額5,000万円から1,200万円へと3,800万円の減額に成功したことがある。
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