税務調査

税務調査で絶対に損しないための完全攻略ガイド

iwamoto
税理士 岩本隆一
税理士 岩本隆一
登録番号140245
東京地方税理士会
横浜中央支部
Profile
岩本隆一税理士事務所代表
税理士業界歴19年。税務調査回数106回。無申告案件346件の経験を持つ税理士です。(2025/04/30現在)
【相談事例】
建設業A社は5年間無申告状態で税務調査が入りました。
①初回面談で詳細なヒアリング
②2回目の面談で税務調査対応の練習
③税務調査当日の適切な対応
④調査後に経費計上の交渉を行う
結果として当初想定指定した追徴税額5,000万円から1,200万円へと3,800万円の減額に成功したことがある。
【セミナー実績】
あなたの帳簿、AIに丸見えです!デジタル時代の税務調査リスクと防衛術(株式会社ジャイアントキリング主催)
電子帳簿保存法説明会(公益社団法人横浜中法人会研修委員会主催)
「岩本先生にお願いして本当によかった」と言われることが何よりの喜びです。
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税務調査で絶対に損しないための完全攻略ガイド

どうも、税理士の岩本です!

税務調査って聞くと「うわぁ…」って思う人が多いんですけど、実はそんなに怖いものじゃないんですよ。私も20年以上この仕事をやってきて、数え切れないほどの税務調査に立ち会ってきましたが、正しい知識と準備があれば全然大丈夫です。

今日は皆さんに安心してもらえるよう、私の経験をもとに実践的なお話をしていきますね。

なんでこの記事を書いたの?

税務調査について調べても「○○税理士事務所にお任せください!」みたいな宣伝ばっかりで、結局何をすればいいのかよくわからないじゃないですか。

で、実際に税務調査を経験した人に聞いても「いやー、もう大変だった…」みたいな話ばかりで、具体的にどう対処すればいいかわからない。

そんなモヤモヤを解決するために、私の経験をフル活用して「これ読んどけば大丈夫」な記事を作りました。お客さんからよく聞かれる質問も全部盛り込んでます。

そもそも税務調査って何?

税務署の人が突然やってくる?

よくある勘違いなんですが、税務調査って突然やってくるものじゃないんです。必ず事前に連絡があります。『明日伺います!』なんてことは私の20年以上の経験でもありません(笑)

税務調査を一言で説明すると「税務署の人が『ちゃんと税金払ってる?』って確認しに来ること」です。

別に悪いことしてなくても来ます。むしろ「健康診断」みたいなもんだと思ってください。私もお客さんには「普段から健康に気をつけていれば、健康診断も怖くないでしょ?」って説明してます。

任意調査 vs 強制調査

任意調査

  • 普通の税務調査はこれ
  • 「協力してくださいね〜」というスタンス
  • でも基本的に断れない

強制調査

  • 俗に言う「マルサ」
  • 裁判所の令状が必要
  • よっぽど悪質じゃないと来ない

99.9%の人は任意調査なので、強制調査のことは心配しなくて大丈夫です。私のお客さんでも強制調査を受けた人はほとんどいません。

詳しくはこちらの記事をご確認ください。

個人事業主の人、これだけは知っておいて

いくらから税務調査が来るの?

みんなが一番気になるこの質問。正直、明確な基準はないんですが、私の経験上、売上1000万円を超えると注目度が上がりますね。でも500万円でも来ることはあります。逆に3000万円でも来ない人もいる。

要は「怪しさ」なんです。私はいつもお客さんに「怪しまれないようにしましょう」って言ってます。

怪しまれやすいパターン

  • 去年と今年で売上が倍以上違う
  • 経費率が同業者と比べて異常に高い
  • 現金商売なのに現金の動きが不自然
  • SNSで豪遊してるのに所得が少ない(←これ意外と見られてる)

私のお客さんでも、Instagram で高級車や高級時計の写真をバンバン上げてるのに、申告所得が200万円とかの人がいて、案の定調査が来ました。SNS時代は特に気をつけないといけませんね。

個人事業主がチェックされるポイント

私がこれまで立ち会った個人事業主の調査で、よく指摘される項目をまとめました。

  1. 売上の計上もれ
    • 「あ、この入金忘れてた」は通用しません
    • 私も決算前にはお客さんと入金チェックを必ずやります
  2. 経費の水増し
    • プライベートの飲み会を「接待交際費」にしてない?
    • 家族旅行を「出張費」にしてない?
  3. 家事按分の適正性
    • 家賃の90%を経費にしてたらアウト
    • 私は「常識的な範囲で」っていつも言ってます

一番多いのは「これ経費でいいよね?」って勝手に判断しちゃうパターン。私のところにも調査後に「実は…」って相談に来る人が多いんです。迷ったら事前に聞いてください。相談料をケチって後で何十万も追徴されるより、事前に相談した方が絶対にお得です。

法人の社長さん向け:会社の税務調査あるある

法人の税務調査の特徴

個人と違って、法人の税務調査はもうちょっと本格的です。私もいつも気合を入れて準備します。

調査期間

  • 個人:1日〜2日
  • 法人:2日〜3日(規模によってはもっと)

調査される税目

  • 法人税
  • 消費税
  • 源泉所得税
  • (場合によっては住民税も)

法人でよく指摘される項目

法人の場合、個人より複雑なので論点が多いんです。でも逆に言えば、ポイントを押さえておけば大丈夫。私がいつもお客さんにチェックしてもらっている項目があります。

  1. 売上の期ずれ
    • 3月決算なのに4月の売上を3月に計上してない?
    • 私は決算月の前後の売上は特に注意深くチェックします
  2. 役員給与の問題
    • 期中で勝手に変更してない?
    • 役員給与は原則として期中変更NGです
  3. 交際費の範囲
    • 1人5000円超の飲食は交際費です
    • 私のお客さんには「飲み会の人数と金額をメモしておいて」って言ってます
  4. 外注費と給与の区分
    • 実質的に社員なのに外注費にしてない?
    • これは結構グレーゾーンが多いので、私も慎重に判断します

税目別の「ここを見られがち」ポイント

消費税の税務調査

消費税は計算が複雑なので、間違いが多いんです。私も毎回チェックに時間をかけています。特に課税売上割合の計算とか、間違いやすいポイントがいくつかあります。

よくある間違い

  • 課税売上と非課税売上の区分
  • 仕入税額控除の要件不備
  • 簡易課税の売上区分ミス

私のお客さんでも、不動産業の方が土地の売上を課税売上に入れちゃって、課税売上割合が100%になってしまったケースがありました。土地の売上は非課税なんですけどね。

相続税の税務調査

特徴的なポイント

  • 亡くなってから1〜2年後に来る
  • 「名義預金」を徹底的に調べられる
  • 生前贈与の有無もチェック

相続税の調査は家族全員に影響するので、事前の準備が特に大切です。私も相続案件の時は、通常の調査以上に準備に時間をかけます。

特に名義預金の判定は難しくて、私も税務署とやり取りすることが多いです。「お父さんの名前だけど、実際に管理してたのは息子さんですよね?」みたいな指摘を受けることがあります。

源泉徴収の税務調査

チェックされるポイント

  • アルバイトの源泉徴収漏れ
  • 外注先への支払いの源泉徴収
  • 税理士報酬の源泉徴収

私も税理士なので、お客さんから源泉徴収してもらう立場なんですが、たまに源泉徴収を忘れる会社さんがいて、調査で指摘されることがあります。

税務調査の流れを時系列で解説

私が実際に経験している調査の流れを、時系列で詳しく説明しますね。

1. 事前通知(調査の2週間前くらい)

電話がかかってきます。

調査官:「○○税務署の△△です。税務調査をさせていただきたく…」

ここで確認すること

  • 調査対象期間(「令和○年から○年まで」)
  • 調査対象税目(法人税、消費税など)
  • 調査予定日時
  • 持参する書類

この時点で私のような税理士に連絡してください。「後で相談します」はNG。その場で「税理士と相談して折り返します」と伝えましょう。私もお客さんには必ずそう指導しています。

2. 日程調整

交渉可能なポイント

  • 調査日時(平日の営業時間内が基本)
  • 調査場所(基本的に事業所)
  • 税理士の同席

無理に早い日程にする必要はありません。準備期間は大切です。私はいつもお客さんに「最低1週間は準備期間を取りましょう」って言ってます。税務署も無茶は言ってきません。

3. 調査当日

朝の流れ

  • 挨拶・身分証明書の確認
  • 調査の説明
  • 質問開始

基本的な心構え

  • 嘘はつかない(バレます)
  • 分からないことは「分からない」
  • 推測で答えない
  • 感情的にならない

「すみません、記録を確認させてください」は魔法の言葉。即答する必要はないんです。私がお客さんに一番伝えたいのはこれです。焦って間違った答えをするより、確認してから正確に答える方が絶対にいい。

私も調査に同席するときは、お客さんが焦らないよう、「確認してから答えましょう」って声をかけています。

4. 調査終了・結果説明

パターン別対応

  • 問題なし:「ありがとうございました」で終了
  • 軽微な指摘:修正申告を検討
  • 重大な問題:税理士と対策協議

私の経験だと、きちんと準備していれば「問題なし」で終わることが多いです。

何年前まで調べられるの?時効の話

基本的なルール

よく「3年」って聞きますが、実際はもうちょっと複雑なんです。私もお客さんに説明する時は、ケースバイケースって話をします。

一般的なケース

  • 通常の調査:過去3年分
  • 重要な取引:過去5年分
  • 意図的な隠蔽:過去7年分

時効の考え方

更正・決定の除斥期間

  • 申告期限から5年(通常)
  • 申告期限から7年(偽りその他不正行為)

「もう時効だから大丈夫」って思ってても、不正があったら7年遡られるので注意してください。私のお客さんにも「時効は当てにしちゃダメ」って言ってます。

書類保存のルール

法定保存期間

  • 帳簿:7年間
  • 決算書類:7年間
  • 証憑書類:7年間

デジタル化が進んでるので、スキャンして保存でもOKです。ただし、一定の要件があるので確認してください。私のお客さんには電子帳簿保存法の要件も含めて説明してます。

調査官がチェックする「あの項目」

売上関係

調査官が一番時間をかけるのは売上です。ここが一番重要。私も関与先の調査の時は、売上関係の資料を特に入念に準備します。

チェック方法

  • 通帳の入金と売上の照合
  • 請求書と入金のタイミング確認
  • 現金売上の裏付け資料

よくある指摘

  • 期末の売上計上もれ
  • 現金売上の記録不備
  • 売上除外(これは重加算税対象)

私のお客さんでも、期末の売上を翌期に回しちゃって指摘されたケースがあります。「まだ入金されてないから」って理由だったんですが、売上の計上は入金ベースじゃなくて実現ベースなんですよね。

経費関係

領収書チェックのポイント

  • 日付、金額、宛名
  • 但し書きの内容
  • 事業関連性

「お品代」だけの領収書は説明できるようにしておいてください。「何を買ったんですか?」って絶対聞かれます。私のお客さんにも「領収書の裏にメモを書いておいて」って言ってます。

危険な経費

  • 家族との食事を接待交際費
  • プライベート旅行を出張費
  • 個人的な買い物を消耗品費

私も「これは経費になりますか?」って聞かれることが多いんですが、グレーゾーンの場合は「事業関連性を説明できるかどうか」で判断してます。

現金管理

現金商売の人は要注意

  • レジ締めと帳簿の照合
  • 釣り銭の管理
  • 売上金の入金タイミング

現金商売の人は、毎日のレジ締め表を作ることをおすすめします。私も現金商売のお客さんには必ず指導してます。これがあるかないかで調査の印象が全然違います。

やばい、ペナルティくらった時の対処法

加算税の種類

過少申告加算税

  • 追加税額の10%(一部15%)
  • 「うっかりミス」レベル

無申告加算税

  • 納付税額の15%(一部20%)
  • 申告してなかった場合

重加算税

  • 35%〜40%
  • 「意図的に隠した」と判断された場合

重加算税だけは絶対に避けたい。これがつくと今後の調査でも要注意人物扱いされます。私も重加算税がつかないよう、普段から気をつけてもらってます。

私のお客さんでも、売上を意図的に除外して重加算税を受けた方がいます。その後の調査では、毎回厳しくチェックされるようになりました。

延滞税を安くする方法

計算式がややこしいんですが…

  • 年7.3%〜14.6%(年によって変動)
  • 日割り計算

対策

  • 早期の修正申告
  • 分納の申請
  • 納税猶予の検討

延滞税は1日でも早く払えば安くなります。「後で払おう」は損します。私のお客さんには「とにかく早く払って」って言ってます。

自主的修正申告のメリット

ペナルティが半分になる!

  • 調査前の自主修正:過少申告加算税なし
  • 調査中でも調査官の指摘前:加算税が軽減

「あ、間違いに気づいた」と思ったら、すぐに修正申告することをおすすめします。私もお客さんには「気づいた時点で相談してください」って伝えてます。

早期の修正申告で加算税を免れたケースは、私の経験でも何度もあります。

事前準備で90%決まる!やっておくべきこと

書類整理のコツ

調査当日にバタバタするのが一番印象悪いです。事前準備で勝負は決まります。私はいつもお客さんに「調査は準備で8割決まる」って言ってます。

整理のポイント

  1. 年度別・月別に分ける
    • ファイルにインデックスをつける
    • デジタルならフォルダ分け
  2. 科目別に分類
    • 交際費、旅費交通費など
    • 同じ科目でもまとめておく
  3. 説明資料を作成
    • 大きな取引の説明書
    • 特殊な処理の根拠資料

私は調査前に必ずお客さんと一緒に書類整理をします。この時に問題点も洗い出せるので、一石二鳥なんです。

チェックリスト

調査1週間前までに準備するもの □ 申告書控え(過去3年分) □ 総勘定元帳 □ 現金出納帳 □ 預金通帳(コピーでOK) □ 請求書・領収書(月別ファイル) □ 契約書類 □ 給与台帳・源泉徴収票 □ 法定調書

当日朝の準備 □ 身だしなみを整える □ 会議室・応接室の準備 □ お茶・コーヒーの用意 □ 税理士への連絡確認

このチェックリストは私が実際に使っているものです。お客さんにもコピーして渡してます。

税理士との連携

調査に税理士が同席するかどうかで、結果が大きく変わることがあります。私も同席した調査としなかった調査では、明らかに結果が違います。

税理士同席のメリット

  • 専門的な質問への適切な回答
  • 納税者の権利を守る
  • 感情的になりがちな場面での仲裁
  • 調査後の対応アドバイス

同席を依頼するタイミング

  • 事前通知を受けた時点
  • 遅くとも調査1週間前

私の場合、調査の同席料は1日10万円をいただいてますが、それ以上の価値は絶対にあると思ってます。

リアルな体験談と失敗例

成功例:準備が功を奏したケース

飲食店経営・Aさんの場合

「毎日のレジ締めをきちんとやってて、売上と現金の動きが一致してたんです。調査官も『きちんと管理されてますね』って言ってくれて、1日で調査終了でした。」

現金商売の方は、この例を参考にしてください。日々の積み重ねが大切です。私のお客さんでも、普段からきちんと管理している人は調査がスムーズに終わります。

失敗例:これはやっちゃダメ

IT企業経営・Bさんの場合

「領収書をもらい忘れることが多くて、レシートとかメモで処理してたんです。調査の時に『これは何の支払いですか?』って聞かれても説明できなくて…結局、経費として認められない項目がたくさん出てきました。」

証憑書類の不備は一番もったいないパターンです。私も普段から「領収書は絶対もらって」って口うるさく言ってます。

重加算税を受けた失敗例

建設業経営・Cさんの場合

「現金で受け取った工事代金を、一部申告しないでいたんです。『バレないだろう』って思ってたら、取引先への反面調査でバレて重加算税…。税務署って本当によく調べるんですね。」

「バレないだろう」は絶対にダメ。私のお客さんには「税務署をなめちゃいけない」って言ってます。

最後に:税理士岩本からのメッセージ

長い記事を最後まで読んでいただき、ありがとうございました。

税務調査は確かに緊張するものですが、正しい知識と準備があれば決して怖いものではありません。私が20年以上税理士をやってきて感じるのは、「普段からコツコツと正しい処理をしている人は、調査でも問題になることはほとんどない」ということです。

大切なのは:

  1. 正確な記帳:面倒でも日々の記録をしっかりと
  2. 証憑の保管:領収書や請求書は必ず保管
  3. 早めの相談:わからないことは専門家に相談
  4. 誠実な対応:調査官には正直に対応

私もお客さんには「税務調査は健康診断みたいなもの」って言ってます。普段から健康に気をつけていれば、健康診断も怖くないですよね。

もし税務調査の通知が来ても、慌てずに私のような専門家に相談してください。適切な準備と対応で、きっと乗り切れます。

皆さんの事業が健全に発展していくことを心から願っています。

困った時は 税務調査でお困りの際は、経験豊富な税理士にご相談を。早めの相談が、問題を最小限に抑える秘訣です。




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